【学术讲座】使用零膨胀概率PCA模型进行微生物组数据分析

专家简介：王涛，上海交通大学生命科学技术学院研究员，香港浸会大学统计学博士。曾在美国耶鲁大学公共卫生学院从事博士后研究工作，是美国《数学评论》评论员、国际统计学会当选会员，以及耶鲁大学生物统计系客座助理教授。

报告摘要：微生物组数据的分析因几个统计挑战而变得复杂。特别是，通过高通量测序产生的微生物组数据具有计数值、相关性、高维性、过零散性和组成性。为了描述和模拟微生物群落数据，我们引入了一个称为零膨胀概率PCA（ZIPPCA）的通用框架，将概率PCA从高斯分布扩展到多元稀疏计数数据。我们提出了一个负二项ZIPPCA模型用于降维和数据可视化，以及一个逻辑正常多项式ZIPPCA模型用于推断微生物成分。利用负二项ZIPPCA模型，我们还提出了一种精确且鲁棒的微生物组数据去噪方法。我们开发了用于最大似然估计和推理的高效变分近似算法。我们在真实的微生物数据集上展示了所提出的方法的性能。

腾讯会议号：397-945-322

时间：2022年4月6号下午14:00-15:00